正体を現した最高議長

クローン戦争の終盤、ジェダイは共和国軍の将軍として銀河各地の戦場に散っていた。共和国を率いる最高議長パルパティーンは、戦争を理由に強大な権限を手にしていた。その正体が、ジェダイが長く探していたシス卿ダース・シディアスだった。

アナキン・スカイウォーカーからその事実を知らされたメイス・ウィンドゥは、数人のジェダイ・マスターを連れてパルパティーンの逮捕に向かう。同行したキット・フィストーら3人のマスターは、パルパティーンの赤いライトセーバーの前に次々と倒れた。戦いの末、ウィンドゥはパルパティーンを追い詰めた。しかし駆けつけたアナキンがウィンドゥを止め、パルパティーンはその隙にウィンドゥを倒す。アナキンはシディアスの弟子となり、ダース・ベイダーの名を与えられた。

下された命令

パルパティーンは、各地のクローン・トルーパーの指揮官に「オーダー66」を発した。ジェダイを共和国の敵とみなし、ただちに排除せよという命令である。クローン兵たちは、それまで共に戦ってきたジェダイの将軍たちに一斉に銃を向けた。クローン兵の頭には、生まれたときから命令に従わせるための装置が埋め込まれていたことが、のちに明らかになっている。兵士たちは迷うことなく命令を実行した。

ウータパウでは、コーディ司令官の部隊がオビ＝ワン・ケノービを砲撃した。オビ＝ワンは乗っていた生き物ごと谷底の水に落ち、かろうじて生き延びる。キャッシークではヨーダが襲いかかるクローン兵を退け、ウーキーの助けで脱出した。しかしほかの多くの星では、ジェダイは不意を突かれて次々に倒れていった。凍てつく惑星マイギートーではキ＝アディ＝ムンディが、密林の惑星フェルーシアではアイラ・セキュラが、戦闘機で飛んでいたプロ・クーンも、背後から撃たれて命を落とした。ヨーダは遠く離れた場所で、仲間の死をフォースで感じ取っていた。

聖堂への襲撃

コルサントでは、ベイダーとなったアナキンがクローン兵の部隊を率いてジェダイ聖堂を襲った。聖堂に残っていたジェダイは、まだ幼い訓練生も含めて命を奪われる。聖堂から煙が上がる様子を見て駆けつけた元老院議員ベイル・オーガナも、クローン兵に追い返された。ベイルはその後、キャッシークから脱出したヨーダを自分の船で救い出す。

生き残ったオビ＝ワンとヨーダは聖堂に戻り、各地のジェダイを呼び戻す信号を書き換えて、帰還すれば罠にかかると警告した。そして聖堂の記録映像から、襲撃を率いたのがアナキンだったことを知る。

なにが変わったか

パルパティーンは、ジェダイが自分を殺して共和国を乗っ取ろうとしたと元老院で訴え、粛清を正当化した。ジェダイ騎士団はこの事件でほぼ壊滅し、銀河の平和の守り手は姿を消す。

オビ＝ワンとヨーダは身を隠し、生き延びたわずかなジェダイも長い潜伏を強いられた。オーダー66は、共和国の終わりと銀河帝国の始まりを決定づけた出来事になった。